噴射式超聲波清洗機的功率選擇，其清洗效果不一定和（功率×清洗時間）成反比，噴射式超聲波清洗機假如功率達到一定數值，有時很快便將污垢去除。若選擇功率太大，空化強度將大大增加，清洗效果是提高了，但這時使較精密的零件也產生蝕點，得不償失，而且清洗缸底部振動板處空化嚴重，水點腐蝕也增大，在采用三氯乙烯等有機溶劑時，基本上沒有問題，但采用水或水溶性清洗液時，易于受到水點腐蝕，假如振動板表面已受到傷痕，強功率下水底產生空化腐蝕更嚴重，因此要按實際使用情況選擇超聲功率。
噴射式超聲波清洗機的頻率的選擇
噴射式超聲波清洗機的超聲清洗頻率會從十幾kHz到100kHz之間，在使用水或水清洗劑時由空穴作用引起的物理清洗力顯然對低頻有利，一般使用15-30kHz左右。對小間隙、狹縫、深孔的零件清洗，用高頻（一般40kHz以上）較好，甚至幾百kHz。對鐘表零件清洗時，用400kHz。若用寬帶調頻清洗，效果更良好。
噴射式超聲波清洗機需要清洗籠的使用，在清洗小零件物品的時候，超聲波焊接機常使用網籠，由于網眼要引起超聲衰減，二手超聲波焊接機要特別引起注意。當頻率為28khz時使用10mm以上的網眼為好。
噴射式超聲波清洗機的清洗液溫度的選擇水清洗液適宜的清洗溫度為40-60℃，尤其在天冷時若清洗液溫度低空化效應差，清洗效果也差。因此有部分清洗機在清洗缸外邊繞上加熱電熱絲進行溫度控制，當溫度升高后空化易發生，所以清洗效果較好。當溫度繼續升高以后，空泡內氣體壓力增加，引起沖擊聲壓下降，反應出這兩因素的相乘作用。